Untuk setiap protein, selain protein utama, ada juga protein tertentu struktur sekunder . Biasanya molekul protein menyerupai pegas yang memanjang.
Inilah yang disebut a-heliks, yang distabilkan oleh banyak ikatan hidrogen yang muncul antara gugus CO dan NH yang terletak di dekatnya. Atom hidrogen dari gugus NH satu asam amino membentuk ikatan seperti itu dengan atom oksigen dari gugus CO dari asam amino lain, dipisahkan dari asam amino pertama oleh empat residu asam amino.
Dengan demikian asam amino 1 ternyata berikatan dengan asam amino 5, asam amino 2 menjadi asam amino 6, dan seterusnya. Analisis struktur sinar-X menunjukkan bahwa terdapat 3,6 residu asam amino per putaran heliks.
Konformasi heliks sepenuhnya dan, oleh karena itu, protein keratin memiliki struktur fibrilar. Itu struktural protein rambut, wol, kuku, paruh, bulu dan tanduk, yang juga merupakan bagian dari kulit vertebrata.
Kekerasan dan kelenturan keratin bervariasi tergantung pada jumlah jembatan disulfida antara rantai polipeptida yang berdekatan (derajat ikatan silang rantai).
Secara teoritis, semua gugus CO dan NH dapat berpartisipasi dalam pembentukannya ikatan hidrogen, jadi α-helix adalah konformasi yang sangat stabil dan karenanya sangat umum. Bagian heliks α dalam molekul menyerupai batang kaku. Namun, sebagian besar protein ada dalam bentuk globular, yang juga mengandung daerah (3 lapisan (lihat di bawah) dan daerah dengan struktur tidak beraturan.
Hal ini dijelaskan oleh fakta bahwa pendidikan ikatan hidrogen Hal ini terhambat oleh sejumlah faktor: adanya residu asam amino tertentu dalam rantai polipeptida, adanya jembatan disulfida antara berbagai bagian rantai yang sama, dan, terakhir, fakta bahwa asam amino prolin umumnya tidak mampu membentuk ikatan hidrogen.
Lapisan Beta, atau lapisan terlipat adalah jenis lain dari struktur sekunder. Fibroin protein sutera, yang disekresikan oleh kelenjar ulat sutera yang mensekresi sutera ketika menggulung kepompong, seluruhnya terwakili dalam bentuk ini. Fibroin terdiri dari sejumlah rantai polipeptida yang lebih memanjang dibandingkan rantai dengan konformasi alfa. spiral.
Rantai-rantai ini tersusun secara paralel, tetapi rantai-rantai yang berdekatan berlawanan arah satu sama lain (antiparalel). Mereka terhubung satu sama lain menggunakan ikatan hidrogen, muncul antara gugus C=0- dan NH dari rantai tetangga. Dalam hal ini, semua gugus NH dan C=0 juga berperan dalam pembentukan ikatan hidrogen, yaitu strukturnya juga sangat stabil.
Konformasi rantai polipeptida ini disebut konformasi beta, dan strukturnya secara keseluruhan merupakan lapisan terlipat. Ia memiliki kekuatan tarik yang tinggi dan tidak dapat diregangkan, tetapi susunan rantai polipeptida ini membuat sutra sangat fleksibel. Pada protein globular, rantai polipeptida dapat terlipat dengan sendirinya, dan kemudian pada titik-titik tersebut muncul daerah globular yang mempunyai struktur lapisan terlipat.
Lain metode pengorganisasian rantai polipeptida kita temukan di kolagen protein fibrilar. Ini juga protein struktural, yang, seperti keratin dan fibroin, memiliki kekuatan tarik yang tinggi. Kolagen memiliki tiga rantai polipeptida yang dipilin menjadi satu, seperti untaian tali, membentuk triple helix. Setiap rantai polipeptida dari heliks kompleks ini, yang disebut tropocollagen, mengandung sekitar 1000 residu asam amino. Rantai polipeptida individu bebas spiral melingkar(tapi bukan a-helix;).
Tiga rantai disatukan ikatan hidrogen. Fibril terbentuk dari banyak heliks rangkap tiga yang tersusun sejajar satu sama lain dan disatukan oleh ikatan kovalen antara rantai yang berdekatan. Mereka pada gilirannya bergabung menjadi serat. Struktur kolagen terbentuk secara bertahap - pada beberapa tingkatan - mirip dengan struktur selulosa. Kolagen juga tidak dapat diregangkan, dan sifat ini penting untuk fungsinya, misalnya pada tendon, tulang, dan jenis jaringan ikat lainnya.
Tupai, yang hanya ada dalam bentuk melingkar penuh, seperti keratin dan kolagen, merupakan pengecualian di antara protein lainnya.
Pada struktur yang lebih kompak dibandingkan dengan struktur primer, dimana terjadi interaksi gugus peptida dengan pembentukan ikatan hidrogen diantara keduanya.
Peletakan tupai berupa tali dan akordeon
Ada dua jenis struktur seperti itu - meletakkan tupai dalam bentuk tali Dan berbentuk akordeon.
Pembentukan struktur sekunder disebabkan oleh keinginan peptida untuk mengambil konformasi jumlah terbesar ikatan antar kelompok peptida. Jenis struktur sekunder bergantung pada stabilitas ikatan peptida, mobilitas ikatan antara atom karbon pusat dan karbon gugus peptida, dan ukuran radikal asam amino.
Semua ini, ditambah dengan urutan asam amino, selanjutnya akan menghasilkan konfigurasi protein yang ditentukan secara ketat.
Ada dua pilihan yang memungkinkan struktur sekunder: α-helix (α-struktur) dan lapisan β-lipit (β-struktur). Biasanya, kedua struktur terdapat dalam protein yang sama, tetapi dalam proporsi yang berbeda. Pada protein globular, α-heliks mendominasi, pada protein fibrilar, struktur β mendominasi.
Partisipasi ikatan hidrogen dalam pembentukan struktur sekunder.
Struktur sekunder terbentuk hanya dengan partisipasi ikatan hidrogen antara kelompok peptida: atom oksigen dari satu kelompok bereaksi dengan atom hidrogen dari kelompok kedua, pada saat yang sama oksigen dari kelompok peptida kedua berikatan dengan hidrogen dari kelompok ketiga, dll.
α-Heliks
Pelipatan protein dalam bentuk α-helix.
Struktur ini adalah heliks tangan kanan, dibentuk oleh ikatan hidrogen antara gugus peptida ke-1 dan ke-4, ke-4 dan ke-7, ke-7 dan ke-10, dan seterusnya residu asam amino.
Pembentukan heliks dicegah oleh prolin dan hidroksiprolin, yang karena strukturnya, menyebabkan “patahnya” rantai, tikungan tajamnya.
Ketinggian putaran heliks adalah 0,54 nm dan setara dengan 3,6 residu asam amino, 5 putaran penuh setara dengan 18 asam amino dan menempati 2,7 nm.
lapisan lipatan β
Protein terlipat menjadi lembaran berlipit β.
Dalam metode pelipatan ini, molekul protein terletak seperti “ular”; bagian rantai yang berjauhan terletak berdekatan satu sama lain. Akibatnya, kelompok peptida asam amino yang sebelumnya dikeluarkan dari rantai protein dapat berinteraksi menggunakan ikatan hidrogen.
Struktur sekunder protein biasa
Struktur sekunder dibedakan berdasarkan bentuk (konformasi) rantai utama yang teratur dan periodik, dengan berbagai konformasi kelompok samping.
Struktur sekunder RNA
Contoh struktur sekunder termasuk batang-loop dan pseudoknot.
Struktur sekunder pada mRNA berfungsi untuk mengatur translasi. Misalnya, penyisipan asam amino yang tidak biasa selenomethionine dan pyrrolysine ke dalam protein bergantung pada stem-loop yang terletak di wilayah 3" yang belum diterjemahkan. Pseudoknot berfungsi untuk perubahan terprogram dalam kerangka pembacaan gen.
Lihat juga
- Struktur Kuarter
Catatan
Yayasan Wikimedia.
2010.
Lihat apa itu “Struktur sekunder protein” di kamus lain:
Struktur sekunder adalah susunan konformasi rantai utama (tulang punggung bahasa Inggris) suatu makromolekul (misalnya, rantai polipeptida suatu protein), terlepas dari konformasi rantai samping atau hubungannya dengan segmen lain. Dalam deskripsi sekunder... ... Wikipedia- - konfigurasi spasial rantai polipeptida, terbentuk sebagai hasil interaksi non-kovalen antara gugus fungsi residu asam amino (struktur protein α dan β) ... Kamus singkat istilah biokimia
Berbagai cara untuk menggambarkan struktur tiga dimensi suatu protein menggunakan contoh enzim triosephosphate isomerase. Di sebelah kiri adalah model “tongkat”, yang menggambarkan semua atom dan ikatan di antara mereka; Warna menunjukkan elemennya. Motif struktural digambarkan di tengah... Wikipedia
Struktur jepit rambut- * struktur jepit rambut atau batang dan lingkaran s. struktur sekunder dalam molekul asam nukleat di mana rangkaian komplementer dalam untai yang sama bergabung membentuk batang untai ganda, sedangkan... Genetika. Kamus Ensiklopedis
Struktur protein- unit struktural utama (monomer) protein adalah residu asam amino yang dihubungkan satu sama lain melalui ikatan peptida menjadi rantai panjang. Rantai individu dapat menarik satu sama lain atau membentuk lingkaran dan membengkok ke belakang, jadi... ... Awal mula ilmu pengetahuan alam modern
Polimer- (Polimer) Pengertian polimer, jenis-jenis polimerisasi, polimer sintetik Informasi Pengertian Polimer, Jenis-Jenis Polimerisasi, Polimer Sintetis Daftar Isi Definisi Latar Belakang Sejarah Ilmu Tentang Polimerisasi Jenis-Jenis ... ... Ensiklopedia Investor
- (biopolimer) makromolekul alami yang memainkan peran dasar. peran dalam biol. proses. Untuk P.b. meliputi protein, asam nukleat (NA), dan polisakarida. hal.b. membentuk dasar struktural semua organisme hidup; semua proses di dalam sel berhubungan dengan... ... Ensiklopedia fisik
Istilah ini memiliki arti lain, lihat Protein (arti). Protein (protein, polipeptida) adalah zat organik bermolekul tinggi yang terdiri dari asam alfa amino yang dihubungkan dalam rantai melalui ikatan peptida. Pada organisme hidup... ... Wikipedia
Protein (protein) membentuk 50% massa kering organisme hidup.
Protein terdiri dari asam amino. Setiap asam amino mempunyai gugus amino dan gugus asam (karboksil), yang interaksinya menghasilkan ikatan peptida Oleh karena itu, protein disebut juga polipeptida.
Struktur protein
Utama- rantai asam amino yang dihubungkan oleh ikatan peptida (kuat, kovalen). Dengan mengganti 20 asam amino dalam urutan berbeda, Anda dapat membuat jutaan protein berbeda. Jika Anda mengubah setidaknya satu asam amino dalam rantai, struktur dan fungsi protein akan berubah, oleh karena itu struktur primer dianggap paling penting dalam protein.
Sekunder- spiral. Ditahan oleh ikatan hidrogen (lemah).
Tersier- bola (bola). Empat jenis ikatan: disulfida (jembatan belerang) kuat, tiga lainnya (ionik, hidrofobik, hidrogen) lemah. Setiap protein mempunyai bentuk globulnya sendiri, dan fungsinya bergantung padanya. Selama denaturasi, bentuk globul berubah, dan ini mempengaruhi fungsi protein.
Kuarter- Tidak semua protein memilikinya. Ini terdiri dari beberapa butiran yang dihubungkan satu sama lain melalui ikatan yang sama seperti pada struktur tersier. (Misalnya, hemoglobin.)
Denaturasi
Ini adalah perubahan bentuk gumpalan protein yang disebabkan oleh pengaruh luar (suhu, keasaman, salinitas, penambahan zat lain, dll.)
- Jika efek pada protein lemah (perubahan suhu sebesar 1°), maka dapat dibalik denaturasi.
- Jika tumbukan kuat (100°), maka terjadi denaturasi tidak dapat diubah. Dalam hal ini, semua bangunan kecuali bangunan utama dihancurkan.
Fungsi protein
Ada banyak sekali, misalnya:
- Enzimatik (katalitik)- protein enzim mempercepat reaksi kimia karena pusat aktif enzim menyesuaikan bentuk zat, seperti kunci gembok (spesifisitas).
- Konstruksi (struktural)- sel, selain air, sebagian besar terdiri dari protein.
- Protektif- antibodi melawan patogen (imunitas).
Pilih salah satu yang paling cocok untuk Anda pilihan yang benar. Struktur sekunder molekul protein berbentuk
1) spiral
2) heliks ganda
3) bola
4) benang
Menjawab
Pilih salah satu, opsi yang paling benar. Ikatan hidrogen antara gugus CO dan NH dalam molekul protein memberikan karakteristik struktur berbentuk heliks
1) utama
2) sekunder
3) tersier
4) kuaterner
Menjawab
Pilih salah satu, opsi yang paling benar. Proses denaturasi molekul protein bersifat reversibel jika ikatannya tidak putus
1) hidrogen
2) peptida
3) hidrofobik
4) disulfida
Menjawab
Pilih salah satu, opsi yang paling benar. Struktur kuaterner molekul protein terbentuk sebagai hasil interaksi
1) bagian dari satu molekul protein menurut jenis ikatan S-S
2) beberapa helai polipeptida membentuk bola
3) bagian dari satu molekul protein karena ikatan hidrogen
4) globul protein dengan membran sel
Menjawab
Tetapkan kesesuaian antara sifat dan fungsi protein yang dijalankannya: 1) pengatur, 2) struktural
A) adalah bagian dari sentriol
B) membentuk ribosom
B) adalah hormon
D) membentuk membran sel
D) mengubah aktivitas gen
Menjawab
Pilih salah satu, opsi yang paling benar. Urutan dan jumlah asam amino dalam rantai polipeptida adalah
1) struktur primer DNA
2) struktur protein primer
3) struktur sekunder DNA
4) struktur sekunder protein
Menjawab
Pilih tiga opsi. Protein pada manusia dan hewan
1) berfungsi sebagai bahan bangunan utama
2) dipecah di usus menjadi gliserol dan asam lemak
3) terbentuk dari asam amino
4) di hati mereka diubah menjadi glikogen
5) dimasukkan ke dalam cadangan
6) sebagai enzim mereka mempercepat reaksi kimia
Menjawab
Pilih salah satu, opsi yang paling benar. Struktur sekunder protein, yang berbentuk heliks, disatukan oleh ikatan
1) peptida
2) ionik
3) hidrogen
4) kovalen
Menjawab
Pilih salah satu, opsi yang paling benar. Ikatan apa yang menentukan struktur utama molekul protein
1) hidrofobik antara radikal asam amino
2) hidrogen antara untaian polipeptida
3) peptida antara asam amino
4) hidrogen antara gugus -NH- dan -CO-
Menjawab
Pilih salah satu, opsi yang paling benar. Struktur utama protein dibentuk oleh ikatan
1) hidrogen
2) makroergik
3) peptida
4) ionik
Menjawab
Pilih salah satu, opsi yang paling benar. Pembentukan ikatan peptida antara asam amino dalam suatu molekul protein didasarkan pada
1) prinsip saling melengkapi
2) ketidaklarutan asam amino dalam air
3) kelarutan asam amino dalam air
4) adanya gugus karboksil dan amina di dalamnya
Menjawab
Ciri-ciri yang tercantum di bawah ini, kecuali dua, digunakan untuk menggambarkan struktur dan fungsi bahan organik yang digambarkan. Identifikasi dua karakteristik yang “tidak termasuk” dari daftar umum dan tuliskan angka-angka yang menunjukkannya.
1) memiliki tingkat struktural organisasi molekuler
2) merupakan bagian dari dinding sel
3) adalah biopolimer
4) berfungsi sebagai matriks untuk penerjemahan
5) terdiri dari asam amino
Menjawab
Semua kecuali dua karakteristik berikut dapat digunakan untuk mendeskripsikan enzim. Identifikasi dua karakteristik yang “keluar” dari daftar umum dan tuliskan angka-angka yang menunjukkannya.
1) merupakan bagian dari membran sel dan organel sel
2) memainkan peran katalis biologis
3) memiliki pusat yang aktif
4) mempengaruhi metabolisme, mengatur berbagai proses
5) protein spesifik
Menjawab
Perhatikan gambar polipeptida dan tunjukkan (A) tingkat organisasinya, (B) bentuk molekulnya, dan (C) jenis interaksi yang mempertahankan strukturnya. Untuk setiap huruf, pilih istilah atau konsep yang sesuai dari daftar yang tersedia.
1) struktur primer
2) struktur sekunder
3) struktur tersier
4) interaksi antar nukleotida
5) sambungan logam
6) interaksi hidrofobik
7) fibrilar
8) berbentuk bulat
Menjawab
Perhatikan gambar polipeptida. Tunjukkan (A) tingkat organisasinya, (B) monomer yang membentuknya, dan (C) jenis ikatan kimia di antara mereka. Untuk setiap huruf, pilih istilah atau konsep yang sesuai dari daftar yang tersedia.
1) struktur primer
2) ikatan hidrogen
3) heliks ganda
4) struktur sekunder
5) asam amino
6) alfa heliks
7) nukleotida
8) ikatan peptida
Menjawab
Diketahui bahwa protein adalah polimer tidak beraturan dengan berat molekul tinggi dan sangat spesifik untuk setiap jenis organisme. Pilihlah tiga pernyataan dari teks di bawah ini yang secara bermakna berkaitan dengan deskripsi karakteristik ini, dan tuliskan nomor di mana pernyataan tersebut ditunjukkan.
Menjawab
(1) Protein mengandung 20 asam amino berbeda yang dihubungkan oleh ikatan peptida. (2) Protein memiliki jumlah asam amino yang berbeda dan urutan pergantiannya dalam molekul. (3) Zat organik dengan berat molekul rendah memiliki berat molekul 100 hingga 1000. (4) Mereka adalah senyawa antara atau unit struktural - monomer. (5) Banyak protein yang dicirikan oleh berat molekul dari beberapa ribu hingga satu juta atau lebih, bergantung pada jumlah rantai polipeptida individu dalam struktur molekul tunggal protein. (6) Setiap jenis organisme hidup mempunyai seperangkat protein khusus dan unik yang membedakannya dari organisme lain.
Semua karakteristik ini digunakan untuk menggambarkan fungsi protein. Identifikasi dua karakteristik yang “tidak termasuk” dari daftar umum dan tuliskan angka-angka yang menunjukkannya.
1) peraturan
2) motorik
3) reseptor
4) membentuk dinding sel
Menjawab
5) berfungsi sebagai koenzim
